这座位于水前寺成趣园西北角的神社建于1878年。一年之前，“西南战争”爆发，这是一场由萨摩（今鹿儿岛县）武士向明治政府发起的叛乱，熊本市大片地区都毁于这场战火。为了振兴这座饱受战火蹂躏的城市，旧熊本藩的家臣们建立了一座神社，供奉为本地带来240多年和平与繁荣的统治者细川家族。
出水神社供奉的主神是一部分细川氏家主的灵位，包括藩祖细川藤孝(1534-1610)；他的儿子细川忠兴(1563-1646)；他的孙子、熊本藩第一代细川氏藩主细川忠利(1586-1641)；熊本藩第六代细川氏藩主细川重贤(1721-1785)。其他敬奉的神灵为直至细川护久(1839-1893)的14代细川氏家主，以及细川忠兴的吉利支丹（自16世纪至明治时代日本的基督教徒）妻子细川·格拉西亚。神社之所以被建造于此，是因为这座庭园与细川家族颇有渊源。
神社“手水舍”（用来供参拜者洗手和漱口的石盆）里的“长寿之水”和那棵形如巴洛克式的松树也是不可错过的亮点，“长寿之水”是发源于阿苏山的地下泉水，松树则是自17世纪上半叶从细川忠利的盆栽培育而来。在2016的地震中，出水神社的三座石鸟居中有一座倒塌，另两座开裂，池塘边的那一座是重建的木结构鸟居。