이 시설은 규슈 신칸센 열차의 보관, 조립, 유지 보수 및 점검을 시행하는 곳으로 대규모 검사와 수리를 하는 공장의 역할도 병행합니다. 구마모토 종합차량기지는 하카타 종합차량기지, 센다이 신칸센 종합차량센터에 이어 세 번째로 큰 규모를 자랑하는 종합 차량기지입니다. 이곳은 기차 마니아들에게 인기가 많습니다.