Der Honmyoji-Tempel ist ein buddhistischer Nichiren-Tempel auf einem Berg im westlichen Kumamoto. Ursprünglich wurde er 1585 in Osaka vom Fürsten der ersten Generation von Kumamoto, Kato Kiyomasa (1562-1611), in Erinnerung an seinen Vater, Kato Kiyotada (1526-1564), erbaut. Kiyomasa verlegte den Tempel schließlich auf das Gelände der Burg Kumamoto; nach Kiyomasas Tod wurde er 1616 an seinen heutigen Standort verlegt.
Das Niomon-Eingangstor stammt aus dem Jahr 1920 und ist aus Beton gefertigt, was damals ein seltenes und neuartiges Material in Japan war. Ein langer Steinweg führt von der Straße zum Honmyoji-Tempel, der am Ende des Weges steht. Der ursprüngliche Tempel brannte während des Satsuma-Aufstandes 1877 nieder; das heutige Gebäude stammt aus dem Jahr 1884. Viele der anderen Gebäude, die den Weg säumen, sind älter als der Haupttempel.
Die Steintreppe, die vom Tempel den Berg hinauf zum Grab von Kato Kiyomasa führt, hat den vielsagenden Namen Munatsuki Gangi ("Fühlt es in eurer Brust"). Sie besteht aus 176 Stufen, die auf beiden Seiten eines MIttelstreifens verlaufen, der mit vier- oder fünfhundert Steinlaternen vollgestopft ist. Am oberen rechten Ende der Treppe, kurz vor dem mittleren Tor, steht eine riesige Laterne mit hölzernen Wetterbrettern um den Sockel herum. In alten Zeiten wurde sie nachts beleuchtet, um den Schrein vom Bergfried der Burg Kumamoto aus sichtbar zu machen.
Hinter dem Tor am oberen Ende der Treppe befindet sich ein mit Steinen gepflasterter Hof, mit dem Mausoleum - bestehend aus einer Anbetungshalle (haiden) mit einem Hauptheiligtum (honden) - direkt dahinter. Das Grab von Kato Kiyomasa befindet sich im honden, zusammen mit den Gräbern von zwei seiner treuesten Gefolgsleute, die bei seinem Tod rituellen Selbstmord begingen. Das Hauptheiligtum stammt aus der frühen Meiji-Ära (1868-1912), obwohl die Anbetungshalle seither mehrmals umgebaut worden ist. In der Meiji-Zeit erzwang die Regierung die Trennung von buddhistischen Tempeln und Shinto-Schreinen, so dass der gottgewordene Geist (kami) von Kato Kiyomasa in den Kato-Schrein verlegt wurde, der sich damals im Inneren der Burganlage von Kumamoto befand. Das Mausoleum wurde mit Blick auf die Burg errichtet. Die Spitze des Hauptheiligtums ist genauso hoch wie der größere der beiden Bergfriede der Burg Kumamoto.
Weitere 300 Stufen den Berg hinauf befindet sich eine Statue von Kiyomasa Kato, die 1960 errichtet wurde. Sie ist das Werk des Bildhauers Kitamura Seibo (1884-1987), der auch die Friedensstatue im Friedenspark von Nagasaki entworfen hat.