夏目漱石(1867-1916)是日本最著名的小说家之一，于1896年4月抵达熊本，在第五高等中学（相当于今天的大学）担任英语教师。之后他一直在熊本生活，直到1900年被教育部派往伦敦学习英语。
内坪井故居是夏目漱石在熊本生活期间居住的6座不同房屋中的第5座，它之所以具有重要意义，主要有两个原因。第一，它是夏目漱石在熊本的居所中，唯一一座保留在原址上且没有多大变化的房屋。还有两处故居虽然也留存了下来，但它们都经过了大改造而面目全非。第二，1899年，夏目漱石的第一个孩子、女儿“笔子”就出生在这里。这所房子有8个房间和一个宜人的庭园，园中有一口井，刚出生的笔子也许就是用这里的井水来清洗的。房子的月租为10日元，相当于今天的10万日元左右。
夏目漱石住在这里的时候才三十出头，还未开始写小说。当时他只是一名英语教师，同时写些俳句。夏目漱石一生写了大约2000首俳句，其中有900首都是在熊本创作的。毫无疑问，他受到了同学的朋友正冈子规(1867-1902)的影响，正冈子规后来成了一位著名的俳句诗人。
尽管夏目漱石在熊本生活期间还没有开始写小说，但他已经为未来的写作储备了众多素材，1906年出版的《草枕》和《二百十日》都是以熊本为背景的小说。