该设施用于九州新干线的入库、组装、维护和检查等，同时也是进行大规模测试和整修的工厂。熊本综合车辆所是日本第三大车辆所，列于博多综合车辆所和仙台综合车辆所之后。这里非常受电车爱好者的喜爱。