本妙寺是一座位於熊本西部山上的日蓮宗佛寺，最初由熊本藩第一代藩主加藤清正（1562-1611）於1585年建於大阪，以紀念其父加藤清忠（1526-1564）。加藤清正最終將寺廟遷至熊本城中。在他辭世後，寺廟於1616年遷至現址。
建於1920年的仁王門（正門）由當時日本罕見的新型材料——混凝土製成。一條長長的石板路從主路中分出，一直通往位於盡頭的本妙寺。最初的寺廟在1877年薩摩（今鹿兒島縣）武士向明治政府發起叛亂而導致的「西南戰爭」中被燒毀，與1884年重建，因此沿著小路排列的許多其他建築都比主寺廟更古老。
從寺廟上山通往加藤清正墓的石梯，名字叫「胸突雁木」，意為「在心中感受的階梯」。176級台階分列兩側，中間放置了400到500座石燈籠。台階頂端右邊是中門，門前矗立著一座巨大的長夜燈，基座周圍為木製擋風板。過去每到夜晚，長夜燈就會被點燃，以便在熊本城天守閣能遠遠眺望此地。
進入位於台階頂端的大門，是一處石塊鋪就的庭院，緊隨其後的就是由拜殿和本殿（正殿）組成的靈廟建築。加藤清正的陵墓位於本殿，邊上是他兩位忠臣的墳塋，他們在加藤清正死後切腹殉葬。本殿建築可以追溯到明治時代（1868-1912）早期，而拜殿之後幾經重建。明治政府實行「神佛分離」後，加藤清正作為神道教神靈被移至當時位於熊本城內的加藤神社。靈廟的建設同時也考慮到了與熊本城的協調，所以本殿頂部保持了和熊本城的大天守一樣的高度。
再往山上走300級台階，可以看到一座建於1960年的加藤清正像，雕像出自雕塑家北村西望（1884-1987）之手，他還設計了長崎和平公園的和平祈念像。